Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms