Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX1P83916 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX1P83916 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX1P83916 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX1P83916 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX1P83916 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX1P83916 SMCR5-201ENST00000543475 2844 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX1P83916 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX1P83916 MINK1-203ENST00000453408 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX1P83916 ARID4A-206ENST00000431317 5783 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX1P83916 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX1P83916 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX1P83916 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX1P83916 DDR1-238ENST00000446312 3202 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX1P83916 NUF2-201ENST00000271452 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX1P83916 EFHD1-203ENST00000409708 1817 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX1P83916 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 ZNF789-209ENST00000483089 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 DUSP11-202ENST00000443070 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 CEP63-215ENST00000606977 2800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 ST3GAL6-228ENST00000613264 3399 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 ZNF133-201ENST00000316358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 GPC3-201ENST00000370818 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 HTR2C-203ENST00000371951 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 CD27-AS1-209ENST00000545339 1766 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 TRO-202ENST00000319167 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 TRO-203ENST00000375022 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 CES1-201ENST00000360526 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 ODF2-213ENST00000448249 2059 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 USP11-204ENST00000377107 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 RPS24-204ENST00000440692 2814 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CBX1P83916 TRIM68-201ENST00000300747 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX1P83916 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX1P83916 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX1P83916 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX1P83916 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX1P83916 FAM131B-204ENST00000409578 4286 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX1P83916 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX1P83916 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX1P83916 LIG1-221ENST00000613670 3949 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX1P83916 ZNF621-201ENST00000310898 2404 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX1P83916 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX1P83916 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX1P83916 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX1P83916 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX1P83916 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX1P83916 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX1P83916 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX1P83916 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX1P83916 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX1P83916 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX1P83916 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX1P83916 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX1P83916 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX1P83916 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX1P83916 AC000068.1-201ENST00000431090 2097 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX1P83916 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX1P83916 SLC6A7-201ENST00000230671 3739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX1P83916 GPR55-205ENST00000622008 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX1P83916 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX1P83916 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX1P83916 SOX13-203ENST00000367204 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX1P83916 AC023355.1-202ENST00000612262 4242 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX1P83916 SCAF8-203ENST00000417268 4944 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX1P83916 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX1P83916 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX1P83916 POFUT2-203ENST00000349485 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 PTCD2-212ENST00000543322 2029 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 CYP4F12-215ENST00000550308 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX1P83916 PLD5-204ENST00000442594 3305 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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