Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HTRA4P83105 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HTRA4P83105 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTRA4P83105 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTRA4P83105 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTRA4P83105 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTRA4P83105 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTRA4P83105 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HTRA4P83105 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTRA4P83105 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HTRA4P83105 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTRA4P83105 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTRA4P83105 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTRA4P83105 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTRA4P83105 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTRA4P83105 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTRA4P83105 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTRA4P83105 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTRA4P83105 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTRA4P83105 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTRA4P83105 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTRA4P83105 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTRA4P83105 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTRA4P83105 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTRA4P83105 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTRA4P83105 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTRA4P83105 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTRA4P83105 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HTRA4P83105 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTRA4P83105 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HTRA4P83105 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HTRA4P83105 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HTRA4P83105 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HTRA4P83105 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HTRA4P83105 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HTRA4P83105 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HTRA4P83105 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HTRA4P83105 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HTRA4P83105 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HTRA4P83105 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HTRA4P83105 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
HTRA4P83105 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HTRA4P83105 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HTRA4P83105 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HTRA4P83105 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HTRA4P83105 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
HTRA4P83105 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HTRA4P83105 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HTRA4P83105 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HTRA4P83105 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HTRA4P83105 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HTRA4P83105 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HTRA4P83105 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HTRA4P83105 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HTRA4P83105 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HTRA4P83105 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HTRA4P83105 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HTRA4P83105 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HTRA4P83105 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HTRA4P83105 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HTRA4P83105 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HTRA4P83105 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HTRA4P83105 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HTRA4P83105 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HTRA4P83105 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HTRA4P83105 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HTRA4P83105 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HTRA4P83105 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HTRA4P83105 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HTRA4P83105 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HTRA4P83105 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HTRA4P83105 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HTRA4P83105 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HTRA4P83105 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HTRA4P83105 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HTRA4P83105 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HTRA4P83105 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HTRA4P83105 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HTRA4P83105 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HTRA4P83105 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HTRA4P83105 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HTRA4P83105 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HTRA4P83105 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HTRA4P83105 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HTRA4P83105 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HTRA4P83105 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HTRA4P83105 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HTRA4P83105 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HTRA4P83105 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HTRA4P83105 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HTRA4P83105 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HTRA4P83105 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HTRA4P83105 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HTRA4P83105 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HTRA4P83105 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HTRA4P83105 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HTRA4P83105 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HTRA4P83105 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HTRA4P83105 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HTRA4P83105 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms