Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms