Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC3P51654 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC3P51654 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC3P51654 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC3P51654 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC3P51654 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC3P51654 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC3P51654 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC3P51654 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPC3P51654 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPC3P51654 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GPC3P51654 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms