Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms