Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPOP42166 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPOP42166 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPOP42166 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPOP42166 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPOP42166 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPOP42166 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPOP42166 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPOP42166 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPOP42166 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPOP42166 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPOP42166 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPOP42166 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPOP42166 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPOP42166 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPOP42166 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPOP42166 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPOP42166 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPOP42166 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPOP42166 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPOP42166 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPOP42166 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPOP42166 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPOP42166 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPOP42166 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPOP42166 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPOP42166 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPOP42166 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPOP42166 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPOP42166 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPOP42166 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPOP42166 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPOP42166 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPOP42166 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPOP42166 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPOP42166 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPOP42166 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPOP42166 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPOP42166 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPOP42166 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPOP42166 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPOP42166 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPOP42166 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPOP42166 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPOP42166 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPOP42166 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPOP42166 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPOP42166 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPOP42166 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPOP42166 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPOP42166 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPOP42166 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPOP42166 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPOP42166 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPOP42166 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPOP42166 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPOP42166 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPOP42166 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPOP42166 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPOP42166 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPOP42166 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPOP42166 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPOP42166 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPOP42166 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPOP42166 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPOP42166 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPOP42166 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPOP42166 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
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