Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms