Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2E1P29083 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms