Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD1P28340 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD1P28340 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD1P28340 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD1P28340 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD1P28340 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD1P28340 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD1P28340 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD1P28340 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD1P28340 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD1P28340 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD1P28340 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD1P28340 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD1P28340 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD1P28340 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD1P28340 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD1P28340 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD1P28340 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD1P28340 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD1P28340 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD1P28340 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD1P28340 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD1P28340 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD1P28340 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD1P28340 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLD1P28340 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLD1P28340 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLD1P28340 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLD1P28340 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLD1P28340 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLD1P28340 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLD1P28340 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLD1P28340 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLD1P28340 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLD1P28340 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD1P28340 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD1P28340 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD1P28340 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD1P28340 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD1P28340 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD1P28340 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD1P28340 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD1P28340 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD1P28340 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD1P28340 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD1P28340 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD1P28340 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD1P28340 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD1P28340 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD1P28340 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD1P28340 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD1P28340 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD1P28340 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD1P28340 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD1P28340 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD1P28340 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD1P28340 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD1P28340 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD1P28340 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD1P28340 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD1P28340 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD1P28340 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD1P28340 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD1P28340 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD1P28340 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD1P28340 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD1P28340 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD1P28340 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD1P28340 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD1P28340 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD1P28340 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD1P28340 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD1P28340 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD1P28340 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD1P28340 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD1P28340 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLD1P28340 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLD1P28340 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLD1P28340 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLD1P28340 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLD1P28340 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLD1P28340 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLD1P28340 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
POLD1P28340 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLD1P28340 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
POLD1P28340 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLD1P28340 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
POLD1P28340 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLD1P28340 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLD1P28340 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLD1P28340 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
POLD1P28340 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLD1P28340 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLD1P28340 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
POLD1P28340 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POLD1P28340 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
POLD1P28340 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms