Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms