Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCP2P22307 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCP2P22307 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCP2P22307 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCP2P22307 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SCP2P22307 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCP2P22307 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCP2P22307 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCP2P22307 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCP2P22307 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCP2P22307 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SCP2P22307 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCP2P22307 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCP2P22307 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCP2P22307 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCP2P22307 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCP2P22307 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCP2P22307 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCP2P22307 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCP2P22307 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SCP2P22307 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCP2P22307 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SCP2P22307 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCP2P22307 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCP2P22307 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCP2P22307 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCP2P22307 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SCP2P22307 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCP2P22307 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCP2P22307 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCP2P22307 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCP2P22307 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCP2P22307 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCP2P22307 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCP2P22307 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCP2P22307 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCP2P22307 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCP2P22307 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCP2P22307 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCP2P22307 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCP2P22307 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCP2P22307 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCP2P22307 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCP2P22307 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCP2P22307 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCP2P22307 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCP2P22307 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCP2P22307 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCP2P22307 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCP2P22307 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCP2P22307 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCP2P22307 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCP2P22307 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCP2P22307 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCP2P22307 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCP2P22307 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCP2P22307 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCP2P22307 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCP2P22307 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCP2P22307 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCP2P22307 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCP2P22307 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCP2P22307 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCP2P22307 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCP2P22307 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCP2P22307 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCP2P22307 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCP2P22307 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCP2P22307 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCP2P22307 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCP2P22307 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCP2P22307 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCP2P22307 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCP2P22307 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCP2P22307 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCP2P22307 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCP2P22307 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCP2P22307 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCP2P22307 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCP2P22307 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCP2P22307 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCP2P22307 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCP2P22307 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCP2P22307 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCP2P22307 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCP2P22307 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCP2P22307 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCP2P22307 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCP2P22307 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCP2P22307 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCP2P22307 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCP2P22307 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCP2P22307 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms