Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1P21675 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1P21675 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1P21675 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1P21675 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1P21675 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1P21675 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1P21675 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1P21675 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1P21675 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1P21675 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1P21675 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1P21675 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1P21675 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1P21675 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1P21675 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1P21675 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1P21675 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1P21675 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1P21675 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1P21675 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1P21675 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1P21675 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1P21675 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1P21675 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1P21675 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1P21675 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1P21675 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1P21675 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1P21675 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1P21675 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1P21675 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1P21675 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1P21675 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1P21675 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1P21675 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1P21675 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1P21675 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1P21675 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1P21675 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1P21675 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1P21675 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1P21675 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1P21675 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1P21675 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1P21675 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1P21675 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1P21675 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1P21675 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1P21675 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1P21675 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1P21675 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1P21675 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1P21675 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1P21675 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1P21675 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1P21675 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1P21675 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1P21675 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1P21675 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1P21675 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1P21675 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1P21675 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1P21675 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1P21675 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1P21675 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1P21675 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1P21675 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1P21675 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1P21675 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1P21675 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1P21675 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1P21675 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1P21675 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1P21675 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1P21675 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1P21675 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1P21675 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1P21675 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1P21675 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1P21675 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1P21675 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1P21675 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1P21675 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1P21675 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1P21675 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1P21675 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1P21675 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1P21675 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1P21675 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1P21675 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1P21675 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1P21675 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1P21675 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1P21675 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1P21675 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1P21675 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1P21675 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1P21675 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1P21675 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms