Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms