Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP2A2P16615 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms