Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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CTLA4P16410 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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CTLA4P16410 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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CTLA4P16410 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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CTLA4P16410 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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CTLA4P16410 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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CTLA4P16410 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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CTLA4P16410 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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CTLA4P16410 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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