Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBSLP0DN79 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBSLP0DN79 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CBSLP0DN79 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBSLP0DN79 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms