Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC172P0C7W6 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms