Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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