Protein–RNA interactions for Protein: P02679

FGG, Fibrinogen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGGP02679 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGGP02679 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGGP02679 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGGP02679 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGGP02679 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGGP02679 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGGP02679 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGGP02679 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGGP02679 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGGP02679 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGGP02679 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGGP02679 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGGP02679 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGGP02679 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGGP02679 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGGP02679 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGGP02679 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FGGP02679 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FGGP02679 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGGP02679 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGGP02679 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGGP02679 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGGP02679 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGGP02679 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGGP02679 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGGP02679 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGGP02679 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGGP02679 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGGP02679 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGGP02679 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGGP02679 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGGP02679 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGGP02679 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGGP02679 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGGP02679 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGGP02679 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGGP02679 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGGP02679 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGGP02679 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGGP02679 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGGP02679 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FGGP02679 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FGGP02679 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGGP02679 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGGP02679 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGGP02679 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGGP02679 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGGP02679 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGGP02679 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FGGP02679 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FGGP02679 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms