Protein–RNA interactions for Protein: O95407

TNFRSF6B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF6BO95407 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 SRRT-216ENST00000618262 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 AC078842.2-201ENST00000447529 1835 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 SLC3A1-205ENST00000409387 2334 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms