Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIF4AO95239 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms