Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB3O43889 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREB3O43889 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREB3O43889 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREB3O43889 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREB3O43889 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREB3O43889 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CREB3O43889 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREB3O43889 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREB3O43889 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREB3O43889 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREB3O43889 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREB3O43889 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREB3O43889 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREB3O43889 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREB3O43889 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREB3O43889 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CREB3O43889 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREB3O43889 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREB3O43889 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREB3O43889 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREB3O43889 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREB3O43889 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CREB3O43889 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREB3O43889 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREB3O43889 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CREB3O43889 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREB3O43889 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREB3O43889 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREB3O43889 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREB3O43889 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREB3O43889 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREB3O43889 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREB3O43889 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREB3O43889 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREB3O43889 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CREB3O43889 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CREB3O43889 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CREB3O43889 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CREB3O43889 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CREB3O43889 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CREB3O43889 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CREB3O43889 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CREB3O43889 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CREB3O43889 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CREB3O43889 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CREB3O43889 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CREB3O43889 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CREB3O43889 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREB3O43889 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms