Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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