Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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HOXA3O43365 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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HOXA3O43365 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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HOXA3O43365 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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HOXA3O43365 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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HOXA3O43365 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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HOXA3O43365 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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HOXA3O43365 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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