Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms