Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRRM4A7MD48 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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