Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF22A3QJZ6 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms