Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 ARMCX2-202ENST00000330154 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms