Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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