Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 AP000959.1-201ENST00000441759 977 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 AL031768.1-201ENST00000606542 701 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 WDR54-202ENST00000409791 854 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 AC090696.1-201ENST00000419100 418 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 AC078882.1-201ENST00000436132 416 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 CPA1-207ENST00000484324 1303 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 ZBTB46-AS1-201ENST00000435912 533 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL162P-201ENST00000579233 292 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 AC034205.3-201ENST00000603595 1376 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 YBX1P3-201ENST00000468366 909 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 NMNAT3-212ENST00000511444 873 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 AC078878.2-201ENST00000543451 286 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms