Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CNIH4Q9P003 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms