Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms