Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I4

THSD7B, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7B, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7BQ9C0I4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 GLDC-216ENST00000639639 1559 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 SERPINB8P1-201ENST00000401898 377 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 OR2A1-AS1-203ENST00000468575 568 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 KRT18P42-201ENST00000505048 1255 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 BACE1-207ENST00000510630 1236 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 AC246817.2-204ENST00000517984 562 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 RPL30-213ENST00000523172 274 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 KRT127P-201ENST00000547183 433 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 PEX11A-204ENST00000561224 529 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 CLDN6-203ENST00000572154 461 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 VPREB3-201ENST00000248948 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 SOD1-202ENST00000389995 865 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 VPREB3-202ENST00000398465 503 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 GSG1L2-201ENST00000399363 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 EIF2B5-202ENST00000432569 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 HNRNPA1P3-201ENST00000440968 551 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 LINC02507-201ENST00000509370 1028 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 ZFYVE1-206ENST00000555072 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 SNRPN-208ENST00000577565 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 AC090616.6-202ENST00000583601 1088 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 AC092296.1-201ENST00000587018 566 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 FDPS-220ENST00000611010 1196 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 RAB8A-202ENST00000586682 1315 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 RPS6-201ENST00000315377 863 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 SGCA-202ENST00000344627 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 C9orf24-202ENST00000379124 648 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 SLC2A11-208ENST00000405847 730 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 RBMXP1-201ENST00000408004 1191 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 NOS2P3-201ENST00000411468 867 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 RBMX2P5-201ENST00000424312 969 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 NOS2P2-201ENST00000426269 867 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 AC012513.2-201ENST00000441511 1137 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 YBX1P3-201ENST00000468366 909 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THSD7BQ9C0I4 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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