Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM5Q9C035 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms