Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CELF4Q9BZC1 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms