Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
BCO2Q9BYV7 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCO2Q9BYV7 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms