Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms