Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 PALLD-209ENST00000507735 4379 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFAIP3-206ENST00000612899 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 MXRA5Y-201ENST00000420610 8000 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKG2-201ENST00000264399 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 PANK2-206ENST00000497424 4815 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 SCN5A-202ENST00000333535 8456 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP7-208ENST00000617204 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 EPN3-201ENST00000268933 4071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM95B1-201ENST00000455995 4236 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 KANSL1-208ENST00000574590 5147 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 VDR-202ENST00000395324 4762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF14-201ENST00000367350 7274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 VAT1L-201ENST00000302536 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNMA1-208ENST00000372440 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP14-205ENST00000614411 2207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 L1CAM-202ENST00000361981 5004 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ENOX2-201ENST00000338144 4263 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ZMIZ1-202ENST00000446377 6686 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AC015818.9-201ENST00000591705 4582 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 PAX2-201ENST00000355243 4057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms