Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ABCC3-201ENST00000285238 5716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 CAMKK2-205ENST00000392474 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 CACNA1F-203ENST00000376265 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ADAM19-201ENST00000257527 6481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 TRAF3-201ENST00000347662 7700 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 PPFIA4-201ENST00000272198 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 BCL2L13-202ENST00000337612 4905 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 TGFBRAP1-203ENST00000595531 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 GOLGA4-202ENST00000361924 7772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AKAP13-202ENST00000394510 9128 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ATAD5-201ENST00000321990 6869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms