Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 IGKV3-11-201ENST00000483158 392 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 AC010319.2-201ENST00000594663 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 Metazoa_SRP.122-201ENST00000610476 285 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 BX510359.7-201ENST00000619819 630 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 CMTM5-204ENST00000382809 378 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 HNRNPA1P3-201ENST00000440968 551 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 RN7SL363P-201ENST00000482412 273 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 KRT18P42-201ENST00000505048 1255 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 Metazoa_SRP.147-201ENST00000576563 312 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 AC091691.1-201ENST00000583587 1018 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 GABARAPL1-219ENST00000629504 379 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 ADORA3-204ENST00000632535 1201 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 HNRNPABP1-201ENST00000406003 734 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 AC079325.1-201ENST00000430386 857 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 RBPMSLP-201ENST00000433427 502 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 AC078882.1-201ENST00000436132 416 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 RN7SL47P-201ENST00000488710 299 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 AC114939.1-201ENST00000520980 514 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 COX14-204ENST00000550654 580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 AC078923.1-201ENST00000552856 748 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 AC006504.5-210ENST00000585827 539 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 AL137028.2-201ENST00000614601 256 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 TEX38-201ENST00000334122 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 PIGL-202ENST00000395844 1257 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 LINC01833-204ENST00000444871 581 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 PSMB8-AS1-206ENST00000458296 958 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 STAU2-212ENST00000521419 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 AP001107.9-202ENST00000531602 613 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 PEX11A-204ENST00000561224 529 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 RPL26-209ENST00000584164 873 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 CDIPT-AS1-203ENST00000638164 713 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT140Q96RY7 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms