Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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RNF185Q96GF1 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
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RNF185Q96GF1 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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RNF185Q96GF1 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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RNF185Q96GF1 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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RNF185Q96GF1 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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