Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RMDN1Q96DB5 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RMDN1Q96DB5 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RMDN1Q96DB5 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RMDN1Q96DB5 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RMDN1Q96DB5 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RMDN1Q96DB5 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RMDN1Q96DB5 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RMDN1Q96DB5 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RMDN1Q96DB5 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RMDN1Q96DB5 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RMDN1Q96DB5 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RMDN1Q96DB5 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RMDN1Q96DB5 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RMDN1Q96DB5 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RMDN1Q96DB5 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RMDN1Q96DB5 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RMDN1Q96DB5 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RMDN1Q96DB5 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RMDN1Q96DB5 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RMDN1Q96DB5 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RMDN1Q96DB5 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RMDN1Q96DB5 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RMDN1Q96DB5 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RMDN1Q96DB5 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RMDN1Q96DB5 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RMDN1Q96DB5 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RMDN1Q96DB5 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RMDN1Q96DB5 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RMDN1Q96DB5 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RMDN1Q96DB5 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RMDN1Q96DB5 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RMDN1Q96DB5 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RMDN1Q96DB5 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RMDN1Q96DB5 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RMDN1Q96DB5 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RMDN1Q96DB5 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RMDN1Q96DB5 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RMDN1Q96DB5 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RMDN1Q96DB5 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RMDN1Q96DB5 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms