Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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