Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 LINC01922-201ENST00000562582 719 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms