Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM3CQ92520 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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FAM3CQ92520 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM3CQ92520 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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