Protein–RNA interactions for Protein: Q8N841

TTLL6, Tubulin polyglutamylase TTLL6, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL6Q8N841 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL6Q8N841 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms