Protein–RNA interactions for Protein: Q86X40

LRRC28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC28Q86X40 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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LRRC28Q86X40 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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LRRC28Q86X40 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LRRC28Q86X40 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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