Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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SP6Q3SY56 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SP6Q3SY56 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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SP6Q3SY56 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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SP6Q3SY56 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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SP6Q3SY56 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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SP6Q3SY56 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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SP6Q3SY56 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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SP6Q3SY56 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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SP6Q3SY56 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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SP6Q3SY56 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
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