Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PTPRNQ16849 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PTPRNQ16849 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PTPRNQ16849 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PTPRNQ16849 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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PTPRNQ16849 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PTPRNQ16849 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PTPRNQ16849 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PTPRNQ16849 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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PTPRNQ16849 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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PTPRNQ16849 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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PTPRNQ16849 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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PTPRNQ16849 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRNQ16849 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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PTPRNQ16849 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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